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soap_all_hit_all_output_gff3new
- 将二代高通量测序数据通过soap映射到基因组获得所有映射位点，此脚本解析映射数据，输出GFF3格式。-Will the second generation high-throughput sequencing data obtained by soap mapped to genome mapping sites, this scr ipt all analytical mapping data, output GFF3 format.
Community
- 宏基因组分类程序，专门针对测序深度比较浅的情况，而且短串的分类-Metagenomic binning
Euler-Algorithm-program-CPP
- 详细说明：基因组组装算法 欧拉算法C++源程序：很好的实现基因组组装和拼接的功能，包含实现该功能的所有程序。-Genome assembly algorithms calculate Euler C++ source: well implemented genome assembly and stitching functions, including all procedures to achieve this functionality.
遗传算法——旅行商问题mfc
- 旅行商问题：一个旅行者要去很多城市，每个城市只去一次，问：该怎么走路线最短？ ? ?????? 这个问题可以转化为：随机给n个点，如何连线这n个点，使得连线最短？ ? ?????? 这个问题是遗传算法的经典问题~哈哈~~我试着写了一个程序来解决。 ? ?????? 采用的策略是： 1.?????? 精英主义：每次有2个最优解直接进入下一代。 2.?????? 轮盘赌选择生育：每次对每一代的个体进行一次轮询，如果不适应度<某个随机数，那么选择这个个体进行生育。 3.?????? 单性繁殖：因
基因组互补序列 (2)
- 计算基因组互补序列 用于计算基因的互补序列，附有序列文件可以验证(calculate the complete sequence of genome)
bowtie2_PE_pipeline.pl
- 将配对末端序列比对到参考基因组，并以SAM格式输出比对结果，解析比对结果，获得正确比对的序列信息。(map paired-end reads to reference using bowtie2, output mapped reads in SAM file and then parse mapping results)
liftOver
- 用于基因组不同版本之间的转换，例如hg19转换为hg18.反之亦然(used for the genome transfer)
R and BIOCONDUCTOR
- R语言及BIOCONDUCTOR在基因组分析中的应用(Application of R and BIOCONDUCTOR in genome analysis)
Easyfig-master
- Easyfig为数据基因组比对强大理软件，日常学习工作必需(Easyfig is an powerful image processing software during analyzing bioinformatics)