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md44.tar
- 分子动力学模拟程序,用于材料学方面的科学研究,在此基础上可发展应用到蛋白质等领域的研究-molecular dynamics simulation program for the material aspects of scientific research, on this basis can be applied to the development of protein and other areas of research
gnmlast
- gauss network model方法研究蛋白质折叠的程序,可用来分析蛋白质功能性运动(不好意思,由于疏忽前面上传的是不完整的)-Gauss method network model protein folding process can be used to analyze protein functional Movement (sorry, due to negligence of the previous upload is incomplete)
ANM
- ANM源码,用来分析蛋白质的运动模式,相对于GNM来说,它是含方向的-ANM source to analyze the movement patterns of protein, compared to GNM, it is with the direction
dts_pss_crf
- 用于蛋白质数据生成分类数据的转换。做PSS(Protein Secondary Structure prediction)的可以参考一下。 -for protein production data disaggregated data conversion. Do PSS (Protein Secondary Structure prediction ) can be examined.
PDBSTRUCTURE
- 蛋白质三级结构文件,。ENT格式的,对结构了解有一定帮助。-structural protein 3 documents. ENT format, the right understanding of the structure will definitely help.
DEGREE
- 1、提取原蛋白质相互作用网络的所有节点 2、分别计算原蛋白质相互作用网络每个节点的度 3、从所有节点中选择具有最高度的节点,反复的添加边,直到它的度值等于原蛋白质相互作用网络该节点的度值 4、在为节点添加边时,从剩余节点中选择节点的方法是其度分布近似服从power-low分布 5、令t的值为零,则每个节点被选到的可能性都是相同的,由于在原蛋白质相互作用网络存在大量的低度节点,所以集散节点会优先连接低度节点。 这样创建的网络就为负相关蛋白质互作网络
profile_HMM
- 一个用于蛋白质序列分类的profile hmm的Perl代码
bioinformatics by Baxevanis 中文版
- 随着人类基因组计划的实施,通过基因组测序,蛋白质序列测定结构解析等实验,分子生物学家提供了大量的有关生物分子的原始数据,需要利用现代计算技术对这些原始数据进行收集、整理、管理以便于检索使用。而为了解释和理解这些数据,还需要对数据进行比对、分析,建立计算模型,进行仿真、预测与验证,因而出现生物信息学,它的出现,极大的促进了分子生物学的发展。-With the human genome project implementation, through genome sequencing, protei
dp_align.tar
- 双序列比对:全局比对或局部比对算法,针对蛋白质序列或核酸序列-This program will do Needle global or Smith-Waterman local alignment for two protein sequences or DNA sequences
gnm
- Gauss network model方法研究蛋白质运动模式的程序,可以用来分析蛋白质功能性运动-Gauss method network model protein movement patterns of procedures can be used to analyze protein functional movement
muscle3.7_src
- unix,linux下编译。用于蛋白质,DNA序列比对,支持双序列或多序列比对。 -unix, linux under the compiler. For protein, DNA sequence alignment to support the dual-sequence or multiple sequence alignment right.
scwrl3_lin.tar
- 蛋白质中氨基酸名称的转换,将三字母的氨基酸转换成单字母,单字母的转换成三字母-amino acid name conversion
svmtest
- 利用svm结合向量机实现蛋白质相互作用预测-Svm vector machine achieved with the use of protein-protein interaction prediction
RS
- 这是关于蛋白质序列的RS分析程序,大家可以学习一下!-This is about the RS protein sequence analysis program, we can learn about!
protein
- 用于确定分析蛋白质序列上编码区的一个程序,算法虽然有点过时,但还有些参考价值。-Is used to determine the protein sequence analysis of the coding region of a program, algorithm though a bit outdated, but some reference value.
ClassfyPSPT
- 运用主成分分析算法对蛋白质序列进行分类程序-classfy for protein by principal analysis algrithm
ogaf2
- 蚂蚁优化蛋白质序列,找到蛋白质序列的能量函数的最小值-Ant colony optimization for protein sequences, protein sequences to find the minimum energy function
BioinformaticsToolbox3.2
- 为用户提供了一个开放的、可扩展的环境,用于在药品研究、遗传工程和其他与基因组、蛋白质等相关的项目中进行原型算法的开发以及应用。-Bioinformatics Toolbox™ offers computational molecular biologists and other research scientists an open and extensible environment in which to explore ideas, prototype new algorithms, a
danbaizhi
- 大规模蛋白质相互作用数据的分析与应用。评估可信度方法。-Large-scale protein-protein interaction data analysis and application. Assessment of the credibility of methods.
danbaizhi-de-yipian-hen
- 蛋白质很好的文章,可以方便修改,好好看看吧,很实用的-Classical leapfrog algorithm, well hard Yeah, you can easily modified, can be used to modify the TSP problem