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md44.tar
- 分子动力学模拟程序,用于材料学方面的科学研究,在此基础上可发展应用到蛋白质等领域的研究-molecular dynamics simulation program for the material aspects of scientific research, on this basis can be applied to the development of protein and other areas of research
gnmlast
- gauss network model方法研究蛋白质折叠的程序,可用来分析蛋白质功能性运动(不好意思,由于疏忽前面上传的是不完整的)-Gauss method network model protein folding process can be used to analyze protein functional Movement (sorry, due to negligence of the previous upload is incomplete)
ANM
- ANM源码,用来分析蛋白质的运动模式,相对于GNM来说,它是含方向的-ANM source to analyze the movement patterns of protein, compared to GNM, it is with the direction
profile_HMM
- 一个用于蛋白质序列分类的profile hmm的Perl代码
bioinformatics by Baxevanis 中文版
- 随着人类基因组计划的实施,通过基因组测序,蛋白质序列测定结构解析等实验,分子生物学家提供了大量的有关生物分子的原始数据,需要利用现代计算技术对这些原始数据进行收集、整理、管理以便于检索使用。而为了解释和理解这些数据,还需要对数据进行比对、分析,建立计算模型,进行仿真、预测与验证,因而出现生物信息学,它的出现,极大的促进了分子生物学的发展。-With the human genome project implementation, through genome sequencing, protei
dp_align.tar
- 双序列比对:全局比对或局部比对算法,针对蛋白质序列或核酸序列-This program will do Needle global or Smith-Waterman local alignment for two protein sequences or DNA sequences
gnm
- Gauss network model方法研究蛋白质运动模式的程序,可以用来分析蛋白质功能性运动-Gauss method network model protein movement patterns of procedures can be used to analyze protein functional movement
scwrl3_lin.tar
- 蛋白质中氨基酸名称的转换,将三字母的氨基酸转换成单字母,单字母的转换成三字母-amino acid name conversion
cudaswPPv2.0.7.tar
- 基于cuda的蛋白质搜索算法, Smith-Waterman protein database
data_h
- 一个把DNA或者蛋白质序列转化为以为时间序列的程序,其中运用了混沌游戏表示的迭代算法,是很多后期后期相似性和相关性等分析必须的前提-the program used to transform the DNA or protein sequences into a time series based on chaos game representation
WD
- 基于小波变换的蛋白质折叠速率预测,matlab编写,还可以应用于其他领域(Protein folding rate prediction based on wavelet transform, written in MATLAB, can also be applied to other fields)