rna聚类 将同一个家族的rna按照相似度聚类分组-The same family rna similarity clustering grouped according to similarity

pso优化算法，粒子群算法，也称粒子群优化算法（Particle Swarm Optimization），缩写为 PSO， 是近年来发展起来的一种新的进化算法(（Evolu2tionary Algorithm - EA）。PSO 算法属于进化算法的一种，和遗传算法相似，它也是从随机解出发，通过迭代寻找最优解，它也是通过适应度来评价解的品质，但它比遗传算法规则更为简单，它没有遗传算法的“交叉”(Crossover) 和“变异”(Mutation) 操作，它通过追随当前搜索到的最优值来寻找全局最优。

基因序列比较 人类基因由4种核苷酸，分别用字母ACTG表示。要求编写一个程序，按以下规划比较两个基因序列并确定它们的相似程度。即两 给出两个基因序列AGTGATG和GTTAG，它们有多相似呢？测量两个基因的相似度一种方法称为对齐。使用对齐方法可以在基因的适当位置加入空格，让两个基因的长度相等，然后根据基因的分值矩阵计算分数。 A C G T - A 5 -1 -2 -1 -3 C -1 5 -3 -2 -4 G -2 -3 5 -2 -2 T -1 -2 -2 5

根据图模块划分原理，结合聚类算法蛋白质相似度矩阵的构建的网络进行谱聚类算法-spectral clustering of protein Matrix