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NLP.tools.for.biology.slides
- 介绍自然语言处理工具在生物信息学领域的应用的ppt.作者为uiuc博士生。
batchDnaWalk
- 生物信息学实用工具 批量绘制DNAWalk图形的Perl程序源码 内含使用说明 用基因组DNA序列批量绘制DNAWalk。
指纹识别
- 摘要：指纹识别技术在各个领域的应用已经逐渐成熟，本文基于信息论中的互信息，在指纹识别的特征选取和识别提出自己的一些想法。 1 引言 指纹是人终身不变的生理特征之一，因其具有惟一性、稳定性以及方便性等独特的特点，使指纹识别成为现在应用最广泛的生物识别技术。 指纹识别系统处理的流程中，指纹图像预处理是第一个处理环节，我沿用已经成熟的去噪，二值化，滤波，细化，对其进行预处理。 互信息作为最终的识别准则来进行指纹的识别。 2 指纹的预处理 般自动指纹识别系统由图像采集、图像预处理、细节点提取和指纹匹 几
CAUSA
- CAUSA: 基于密码子-氨基酸联合序列比对构建高精确度分子进化树 生物信息学、基因组学（包括功能基因组学和比较基因组学）的主要目的是研究生物基因、蛋白和基因组的结构和功能，并重构生物基因、蛋白和基因组的进化历史。多序列比对（multiple sequence alignment, MSA)是DNA和蛋白质分子进化分析、以及结构与功能研究的基本工具。目前多序列比对已经有很多方法，如clustalw, MUSCLE, MAFFT, T-Coffee, PRANK，等等，但序列比对依然容易产生系统性
clustalw_1.83.orig.tar.gz
- 经典生物信息学多序列比对工具clustalw，采用Feng-Dolittle渐进比对算法,Classic bioinformatics tools for multiple sequence alignment clustalw, using Feng-Dolittle progressive alignment algorithm
meme_3.5.4
- EM算法的改进，在此基础上生物信息学的常用工具-EM algorithm, on the basis of commonly used bioinformatics tools
genexp
- Java语言编写的生物信息学综合工具软件，它提供了一个统一的界面调用ncbi-blast、clustalw、几个phylip程序、chromtree和treeview 程序，还提供了多序列比对编辑等其他功能。需要安装Java环境、biojava 1.4p1，2.6M，及以上各个独立程序。-Written in Java language integrated bioinformatics tools, which provides a unified interface called ncbi-
lpc-demo
- 图形图象 图片显示 2D图形编程 3D图形编程 绘图程序 波变换 GIS编程 分形几何 图形图像处理 OpenGL 图形/文字识别 压缩解压 加密解密 CA认证 数值算法/人工智能 STL 数据结构 数学计算 人工智能/神经网络 matlab例程 生物技术 Java编程 Applet 游戏 Javascr ipt Jsp/Servlet Ajax *行业应用 医药行业 金融证券系统
bpp-numcalc-1.7.0.tar
- 这是一套生物信息数值计算的工具，欢迎下载使用-This is a set of numerical tools for biological information, please download
mynetwork
- 以Java为程序设计语言，运用强大的JDK工具包，在Eclipse3.2的平台上，以基因数据为研究对象，设计出一款基于人工神经网络数据挖掘的生物信息分析软件。根据基因数据结构，对基因序列的碱基进行编码变换；用户则根据自己的需求通过人机交互界面来自定义网络某些参数，将样本基因数据传入到神经网络当中，继而进行有限次迭代处理，不断调整分布处理单元的连接强度。最后将目标基因数据输入到已经锻炼好的网络中，来对目标基因的未知序列进行预测。运行结果：软件能够无误的运行，且能够较好的对基因序列进行预测。-A J
gephi-0.8.2-beta.sources.tar
- ephi是一款开源免费跨平台基于JVM的复杂网络分析软件, 其主要用于各种网络和复杂系统，动态和分层图的交互可视化与探测开源工具。可用作：探索性数据分析，链接分析，社交网络分析，生物网络分析等。 gephi是一款信息数据可视化利器。-ephi is a free open source cross-platform JVM based complex network analysis software, which is mainly used for a variety of networ
ANN
- 人工神经网络(ANN)，简称神经网络，是一种模仿生物神经网络的结构和功能的数学模型或计算模型。神经网络由大量的人工神经元联结进行计算。大多数情况下人工神经网络能在外界信息的基础上改变内部结构，是一种自适应系统。现代神经网络是一种非线性统计性数据建模工具，常用来对输入和输出间复杂的关系进行建模，或用来探索数据的模式。-Artificial neural network (ANN), referred to as neural network, is a mathematical model of
bioxm2.7
- 生物信息分析，核苷酸蛋白序列比对，蛋白序列分析等。(Biological information analysis, such as nucleotide protein sequence alignment)