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sequence-alignment-matrix-
- 求解序列比对得分矩阵,对于两个序列S和T,令[S]和[T]分别为序列S和T的长度,S[i]和T[j](其中正整数i,j满足0≤j< [S]和0≤j <[T])都属于字符集Ω={A,T,C,G,-},对Ω中的任何元素和空符号。 设计S[i]和T[j]两两之间的一个记分值来比较序列间的同一性的优劣,用记分函数σ(x,y)表示, σ(S[i],T[j])=2 ( S[i]=T[j]≠-);σ(S[i],T[j])= -1 ( S[i]≠T[j],S[i]≠-,T[j]≠-);σ(S