文件名称:viterbiaEM
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所属分类:
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- 上传时间:2014-06-13
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文件大小:10.77mb
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1.用隐马尔科夫模型(HMM)模拟肿瘤细胞整个染色体的拷贝数(CN)变异。并用viteri算法得到最可能的(CN)状态转移序列;
2.使用baum welch算法根据所给序列数据和初始状态转移矩阵,重新估算状态转移矩阵。-HMM, Hidden Markov, baulm welch, viterbi, SNP-array
2.使用baum welch算法根据所给序列数据和初始状态转移矩阵,重新估算状态转移矩阵。-HMM, Hidden Markov, baulm welch, viterbi, SNP-array
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下载文件列表
viterbi&EM/
viterbi&EM/code/
viterbi&EM/code/baum_welch.cpp
viterbi&EM/code/baum_welch.h
viterbi&EM/code/CN.txt
viterbi&EM/code/CRL2324_tQN.txt
viterbi&EM/code/dataft.cpp
viterbi&EM/code/drawimg.m
viterbi&EM/code/EM_states.txt
viterbi&EM/code/hmm.cpp
viterbi&EM/code/hmm.h
viterbi&EM/code/parameters.txt
viterbi&EM/HMM实验报告.docx
viterbi&EM/images/
viterbi&EM/images/allinone.jpg
viterbi&EM/images/baum_welch.png
viterbi&EM/images/chromo1.jpg
viterbi&EM/images/chromo10.jpg
viterbi&EM/images/chromo11.jpg
viterbi&EM/images/chromo12.jpg
viterbi&EM/images/chromo13.jpg
viterbi&EM/images/chromo14.jpg
viterbi&EM/images/chromo15.jpg
viterbi&EM/images/chromo16.jpg
viterbi&EM/images/chromo17.jpg
viterbi&EM/images/chromo18.jpg
viterbi&EM/images/chromo19.jpg
viterbi&EM/images/chromo2.jpg
viterbi&EM/images/chromo20.jpg
viterbi&EM/images/chromo21.jpg
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viterbi&EM/images/chromo8.jpg
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viterbi&EM/images/CN.png
viterbi&EM/images/EM_states.png
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viterbi&EM/code/drawimg.m
viterbi&EM/code/EM_states.txt
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