文件名称:search_genome
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所属分类:
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- 上传时间:2008-10-13
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文件大小:146.05kb
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一个自制的生物信息学程序。
这个程序目的是在基因组文件bsubt168_whole.nuc(部分)中查找设置文件ss.ini所记录的短核苷酸序列CTTAAG(这种短核苷酸一般称寡核苷酸)及其互补序列在该基因组的每10000个碱基中出现的次数。
程序先将碰到的寡核苷酸及其互补序列的位置保存在临时文件ss.tmp中,然后利用这个文件统计每10000个碱基中它们的出现次数并记录在ss.csv中(可用excel打开)。如果某10000个碱基中的出现次数为0,则不被记录。
这个程序目的是在基因组文件bsubt168_whole.nuc(部分)中查找设置文件ss.ini所记录的短核苷酸序列CTTAAG(这种短核苷酸一般称寡核苷酸)及其互补序列在该基因组的每10000个碱基中出现的次数。
程序先将碰到的寡核苷酸及其互补序列的位置保存在临时文件ss.tmp中,然后利用这个文件统计每10000个碱基中它们的出现次数并记录在ss.csv中(可用excel打开)。如果某10000个碱基中的出现次数为0,则不被记录。
(系统自动生成,下载前可以参看下载内容)
下载文件列表
ss.ini
bsubt168_whole.nuc
ss.c
bsubt168_whole.nuc
ss.c
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