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序列比对程式，主要一开始输入两串DNA序列，然后设置MATCH的值，最后算出分数-sequence alignment program, began to import store a DNA sequence, then set up MATCH value, calculate the final score
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本程序是针对多序列比对问题，提出用模拟退火算法来处理。比较好地实现了比对算法，能够得到较好的结果-proceedings against the multiple sequence alignment, proposed using simulated annealing algorithm to handle. Better than the realization of the algorithm to achieve better results
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这也是一款很好的多序列比对软件，在生物信息学的应用中很广泛-This is a very good multiple sequence alignment software, the application of bioinformatics is extensively
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使用动态规划方法进行序列比对的模拟程序,用递归实现-The use of dynamic programming methods of sequence alignment of the simulation program
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blast是目前进行生物序列比对的经典软件，本书介绍了blast的基本原理。-Blast is present in biological sequence alignment of the classic software, this book introduces the basic principle of blast.
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unix,linux下编译。用于蛋白质，DNA序列比对，支持双序列或多序列比对。
-unix, linux under the compiler. For protein, DNA sequence alignment to support the dual-sequence or multiple sequence alignment right.
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基于免疫遗传算法的多重序列比对，但是不包含源程序！-Immune genetic algorithm based on multiple sequence alignment, but does not include the source!
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基于隐马尔可夫模型的并行多重序列比对，不包含源代码！-Hidden Markov Model-based multiple sequence alignment in parallel, and does not include source code!
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This book provides the first unified, up-to-date, and tutorial-level overview of sequence
analysis methods, with particular emphasis on probabilistic modelling. Pairwise alignment,
hidden Markov models, multiple alignment, profile searches, RNA s
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快速的序列比对算法，有高效的检索算法在内，对做全文检索的有参考价值。-Fast sequence alignment algorithm, there are efficient retrieval algorithms, including, for to do full-text search of a reference value.
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matlab2008下实现，序列联配算法，比较两序列的相似性-matlab2008 achieve, sequence alignment algorithms to compare the similarity of two sequences
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a seq algorithm, comparing string, string and sequence alignment
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matlab统计基因序列多序列比对中各个多态性位点中碱基个数-matlab statistics sequence for multiple sequence alignment of various polymorphisms in the number of base
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二叉树的实现，实现了前序，后续，中序排列-Binary tree implementation to achieve the pre-order, follow-up, the sequence alignment
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运用递归算法创建二叉树，并实现先序、中序、后序排列-Recursive algorithm used to create binary tree, and to achieve the first order, in order, after the sequence alignment
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描述
元素以对角线为对称轴对应相等的矩阵。
采用特殊矩阵的压缩存储方式。即使用一维数组保存下三角的矩阵元。
输入
第一行输入矩阵的阶n；
第二行按行序排列的所有下三角矩阵元。（中间用空格分隔）
（例如上图所示矩阵的输入次序为：1 5 0 1 8 9 3 0 2 5 7 0 6 1 3）
第三行为正整数 i和j（0< i, j <=n）-Describe the elements to
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求解序列比对得分矩阵，对于两个序列S和T，令[S]和[T]分别为序列S和T的长度，S[i]和T[j](其中正整数i，j满足0≤j< [S]和0≤j <[T])都属于字符集Ω={A,T,C,G,-},对Ω中的任何元素和空符号。
设计S[i]和T[j]两两之间的一个记分值来比较序列间的同一性的优劣,用记分函数σ(x，y)表示，
σ(S[i],T[j])=2 ( S[i]=T[j]≠-)；σ(S[i],T[j])= -1 ( S[i]≠T[j],S[i]≠-,T[j]≠-)；σ(S
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multipe sequence alignment in matlab
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多序列对齐，先用edit distance做打分矩阵，找到最相近的中心序列。然后用树状图做多序列对齐。-multiple sequence alignment， used edit distance and tree alignment。
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分块递归序列比对算法，是一种基于动态规划思想的全局序列比对方法。
-Block recursive sequence alignment algorithm, it is a global sequence alignment dynamic programming based method.
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