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addhq
- 分子模拟软件 SYBYL 批量能量优化脚本 -It suggested that molecular simulation software Mass Energy Optimization scr ipt
RMSD
- RMSD: Root Mean Square Deviation 是一种在分子模拟及预测中很常见的评价标准，通过Jacobi变换来的到一个大分子和目标分子的相似程度。常用来评价一个三维结构的预测结果是否足够准确.作者主页http://dillgroup.ucsf.edu/~bosco/ 压缩包里的html里还包括有Python代码-RMSD : Root Mean Square Deviation is a molecular simulation and forecasting very
GCMC
- 巨正则系综蒙特卡罗算法的源程序；可以用来进行吸附等分子模拟；最大的好处在于可以插入或删除原子
md1
- 使用FORTRAN90编写的，分子动力学模拟程序，包含了输入文件等等。-MD1 is a FORTRAN90 program which is the first of a series of programs that show a typical molecular dynamics simulation
gromacs-3.3.3.tar
- 最著名最快的分子模拟软件，使用汇编语言完成了程序热点部分-The most famous of the fastest molecular simulation software, the use of assembly language completed the hot part of the procedure
MolDY
- 分子动力学模拟程序MOLDY -molecular dynamics simulation MOLDY
fortran_samples
- 分子动力学模拟的一些程序-Molecular dynamics simulation of a number of procedures
mdsimulation
- CRYSTAL_COORDINATES是一个FORTRAN90程序，使用双精度运算，它产生，一套4 * NX的*NY*NZ 的坐标,分在一个长方形块NX*NY*NZ单元内。 用户可以指定单元的宽度，每一个点的最大的随机位移。 坐标数据写入到一个文件，可用于可视化，或更可能作为初始条件的坐标分子在分子动力学模拟。-CRYSTAL_COORDINATES is a FORTRAN90 program, using double precision arithmetic, wh
simpleMDprogram
- 一个简单的分子动力学程序,十分适合初学者。只模拟了几个分子，可以扩展-A simple molecular dynamics program is very suitable for beginners. Simulated only a few molecules, can be extended
MD
- 从别的网上下来的，是一个简单又经典的分子动力学模拟程序，很适合初级使用。-for molecular simulation
Forcefield_BasedSimulations
- 一本介绍分子模拟中各种力场的书，帮助我们选择合适的力场进行模拟-A descr iption of various molecular modeling force field book to help us select the appropriate force field to simulate
10_MD_1
- 本材料为上海交通大学材料学院的教学讲义，主要讲述了材料计算的原理与模拟概述。主要内容为分子动力学模拟。-This material is material of Shanghai Jiaotong University School of teaching notes, mainly about the principle of material calculation and simulation overview. Molecular dynamics simulation of main
chengxu
- 读分子模拟的GRO文件,文件使用了gro的结构体操作-read gro file
SphereCollision
- 分子动力学模拟实验，在一定膨胀率的条件下，计算碰撞次数，动能、势能-Molecular dynamics simulations, the rate of expansion in certain conditions, the calculated number of collisions, kinetic energy, potential energy
NAMD_2.8_Linux-x86.tar
- 分子动力学软件,可以借助vmd软件观看分子动力学模拟-dynamic
分子动力学-一个简单的小程序
- 采用伦纳德-琼斯势。r由均匀随机数产生，v，a赋零。边界条件为周期边界条件。采用的算法是速度verlet算法。 模拟的系综是正则系综。
Hpp模型模拟气体粒子运动
- 模拟了带小孔容器中气体分子的热运动情况，给出动态图像(The thermal motion of gas molecules in a vessel with a small hole is simulated, and a dynamic image is given)
分子动力学模拟
- 计算原子位置的模拟程序，实时显示原子所在位置(A simulation program for calculating the position of atoms, it shows where the atoms are in real time.)
Desktop
- lammps学习教程，用于学习分子动力学模拟过程的学习和上机操作(lammps munual and Lammps learning tutorial for learning and working on molecular dynamics simulation)
分子模拟动力学
- 分子模拟动力学分子模拟动力学分子模拟动力学分子模拟动力学